Prof. Stefan Troebst jest historykiem i slawistą. Pracował jako historyk na Wolnym Uniwersytecie w Berlinie (1984–1992). W latach 1992–1995 był członkiem misji Organizacji Bezpieczeństwa i Współpracy w Europie (OBWE) w Macedonii i Mołdawii. Był dyrektorem European Centre for Minority Issues (ECMI) (Duńsko-Niemieckiego Europejskiego Centrum Studiów nad Mniejszościami) we Flensburgu. Od 1999 r. jest profesorem kulturoznawstwa Europy Środkowo-Wschodniej na Uniwersytecie w Lipsku i zastępcą dyrektora Lipskiego Humanistycznego Centrum Historii i Kultury Europy Środkowo-Wschodniej (GWZO).
Do marca 2019 r. był członkiem Rady Naukowej Europejskiej Sieci Pamięć i Solidarność (ENRS).